Aufgrund der tropischen Sommerregenzeit (November - Mai) die derzeit im südlichen Afrika anhält, besteht in verschiedenen Landesteilen ein erhöhtes Malariarisiko. Die Zahl der Malariafälle in der Limpopo Provinz steigt weiter an. Seit Beginn der Regenzeit wurden nahezu 1.000 Erkrankungsfälle berichtet. Die Gesundheitsbehörden befürchten, dass die Zahl der Erkrankungen im Verlauf der Regenzeit weiter zunehmen wird. Betroffen sind vor allem Regionen der Tiefebenen wie die Provinz Mpumalanga im Osten (einschließlich des Krüger National Parks und der benachbarten Parks), die Nord Provinz und der Nordosten von Kwazulu-Natal. Ein geringes Risiko besteht im übrigen Norden (im Osten von Kwazulu-Natal bis zum Tugela-Fluß und im Nordwesten bis Swartwater). Während den Regenzeiten stehen für viele Insekten, wie z.B. Mücken vermehrt Brutplätze zur Verfügung. Dadurch nimmt die Anzahl der Überträgermücken zu. Aus diesem Grund treten Krankheiten, die durch Mücken übertragen werden, wie z.B. Malaria, während und nach Regenperioden häufiger auf. Auch Reisende sind bei Aufenthalten in Ländern mit Malaria-Vorkommen gefährdet – vor allem während den Regenzeiten. Daher sollte rechtzeitig vor der Reise eine aufklärende reisemedizinische Beratung erfolgen. Da eine Vielzahl von Faktoren das individuelle Malariarisiko festlegen, sollte in einer gründlichen Nutzen-Risiko Abwägung in einem persönlichen Gespräch mit dem Arzt die richtige Malariaprophylaxe individuell festgelegt werden.

Auch die Masern stellen in Südafrika ein Problem dar. In Kapstadt, der Hauptstadt der Kapprovinz, wurde am ersten Februar eine Masernwarnung öffentlich ausgesprochen. Grund dafür ist ein Masernausbruch, der seit September letzten Jahres in der Gauteng Provinz anhält und sich jetzt auf andere Provinzen ausgebreitet hat. In Kapstadt wurden seit Oktober mehr als 100 Masernfälle gezählt. Die Kapprovinzen, die im Nordosten Südafrikas liegen, warnen vielerorts vor einem erhöhten Masern-Übertragungsrisiko. Auch die Gesundheitsbehörden der Westkap-Provinz meldeten eine Zunahme der Masernfälle. Bis 1. Februar wurden 236 Masernfälle in der Westkapprovinz bestätigt, die seit September 2009 registriert wurden. Bereits im vergangenen Jahr wurden in den Provinzen Gauteng und KwaZulu-Natal über 1.000 Masernfälle bei Kindern in einem Zeitraum von drei Monaten registriert. Auch in der Ostkap-Provinz wurden Masernfälle berichtet - darunter auch ein Todesfall. Bis Mitte Januar wurden die Erkrankungsfälle v.a. aus den Ortschaften Mathojanini, Thwalikulu, Mpaku, Zidindi, Ngcwanguba, Kwaiman und Tshezi gemeldet. In den Regionen Mitchells Plain, Gugulethu, Athlone und Cape Wineland wurden bereits umfangreiche Impfkampagnen gestartet. Sporadische Masernausbrüche sind in der Umgebung von Pretoria und Johannesburg keine Seltenheit. Die beiden Städte gehören auch zu den gern besuchten Touristenzielen Südafrikas. Auch Reisende ohne Immunschutz können erkranken. Ungeimpften Personen bzw. Personen, die noch keine Masern durchgemacht haben und in ein Masern-Risikogebiet reisen oder in medizinischen Einrichtungen zur Behandlung von Kindern, Tagesstätten, Kinderheimen, u. ä. arbeiten, ist eine Schutzimpfung empfohlen.

Landesweit besteht eine erhöhte Infektionsgefahr für diverse Infektionskrankheiten die durch verunreinigte Speisen oder Getränke übertragen werden (z.B. Hepatitis A, Typhus, Bakterienruhr, Amöbenruhr, Lambliasis, Wurmerkrankungen). Daher sollten sorgfältige Nahrungsmittel- und Trinkwasser-Hygienemaßnahmen stets durchgeführt werden. Vor dem Verzehr und Kauf von Lebensmitteln aus billigen Straßenrestaurants und von Märkten wird gewarnt. Nach Deutschland werden rund 80 - 90 % aller Typhus- und Paratyphusfälle aus Reiseregionen mit unzureichendem Hygienestandard importiert. Bei Reisen unter einfachen hygienischen Bedingungen (z.B. Rucksack- und Trekkingreisen) in Regionen mit erhöhtem Typhusvorkomme n, ist daher ein Typhus - Impfschutz sinnvoll. Bei Reisen in Länder mit einem erhöhten Hepatitis A-Vorkommen sollte ein Hepatitis A-Impfschutz in Erwägung gezogen werden.

Generell besteht in den Regionen im Norden, Westen und Osten des Landes ein erhöhtes Infektionsrisiko für Cholera, das insbesondere die einheimische Bevölkerung betrifft. Von der Cholera betroffen sind u.a. die Empangeni-Region (v.a. die unteren Regionen des Umfolozi-Distrikts, sowie Hlabisa, Ngwelezane und Eshowe/Nkandla), die Südküste (KwaDukuza/Stanger, Jozini, die Ugu-Region), des weiteren die Eastern Cape-Provinz, die Northern Province und Port Shepstone. Eines der größten Probleme bildet verunreinigtes Trinkwasser. Vor allem unterernährte, vorerkrankte Menschen mit mangelnder medizinischer Betreuung und einem geschwächten körperlichen Abwehrsystem sind von der Cholera betroffen. Das Infektionsrisiko für Reisende ist sehr gering. Reisenden sind gute Nahrungsmittel- und Trinkwasserhygiene-Maßnahmen empfohlen. Grundsätzlich kann die Cholera-Impfung für Reisende bei Aufenthalten in Cholera-Infektionsgebieten, speziell unter mangelhaften Hygienebedingungen, erwogen werden. Empfohlen ist die Cholera-Impfung für Einsätze bei Katastrophen und Flüchtlingssituationen in endemischen Gebieten (WHO), speziell unter mangelhaften Hygienebedingungen bei aktuellen Ausbrüchen.